К уборке семян приступают на втором году, максимальный уро­жай получают на третьем году вегетации.

Семенники убирают прямым комбайнированием, ког­да в метелках появляется масса зрелых семян и общий фон поля из белого превращается в желто-зеленый. Для их обмолота на комбайне максимально опускают деки, уменьшают до минимума частоту вращения барабана, закрывают все щели, под комбайн подвешивают бре­зент или полотно для предотвращения потерь семян. После дозревания оставшихся на стеблях семян и вы­сыхания валков валериану повторно обмолачивают ком­байном. Иногда применяют раздельный способ уборки.

При этом происходят значительные потери семян. На небольших участках семенники убирают вручную - снопики связывают, отряхивают, потом пропускают че­рез комбайн.